جهت تقویت بنیه علمی دانش‌آموزان دبیرستان دوره اول پسرانه حضرت مجتبی(ع) قبل از هر امتحان کلاس‌های رفع اشکال دروس ریاضی، علوم، عربی و زبان انگلیسی برای پایه‌های هفتم، هشتم و نهم برگزار گردید. همچنین حضور دانش‌آموزان در کلاس‌ها اختیاری بوده است.